Vážení kolegové,

Před 2 týdny jsme se sešli v naší laboratoři s gynekology plzeňského kraje a našimi kolegy z plzeňské Gyn-Por kliniky, abychom probrali vzájemnou spolupráci. Ta již kdysi dávno začala v oblasti screeningu karcinomu cervixu a před několika málo lety jsme vzájemnou spolupráci rozšířili při implementaci molekulární klasifikace do diagnostiky endometriálních adenokarcinomů.

Troufám si říct, že program molekulární klasifikace endometriálních adenokarcinomů jsme dovedli takřka k dokonalosti. Nyní jsou všechny nádory rutinně sekvenovány pomocí NGS onkologickým genovým panelem Gyncore (dle našich požadavků sestavený americkou firmou Archer) a odečítány našimi patology. Máme tak nyní již téměř 400 odsekvenovaných nádorů endometria z mnoha nemocnic Česka. Myslím, že v evropském a možná i světovém měřítku je takových programů minimum. Pro zajímavost uvedu, že zmíněný námi nadesignovaný onkopanel Gyncore je americkou firmou Archer pro tyto účely nyní běžně prodáván na celém světě.

Nyní jsme publikovali již druhou velkou publikaci týkající se molekulární klasifikace endometriálních nádorů (viz Reference), kde prezentujeme naše pozorování, že nádory mající dle NGS profilu nejen mutaci POLE, ale i další relevantní mutace, tedy tzv. „multiple classifier“ typy, se nechovají tak benigně, jak se dodnes uvádělo.

Našeho setkání se zúčastnil i prof. Jiří Moláček, přednosta chirurgické kliniky, který vyjádřil přání zavést do rutinní diagnostiky i molekulární klasifikaci pankreatobiliárních nádorů, což je rovněž úžasné téma, které může přinést do managementu těchto tumorů malou revoluci. Prof. Jiří Moláček by rád profiloval plzeňskou chirurgickou kliniku tímto směrem.

Z našeho hlediska by se jednalo o 3 diagnostická témata:

1. NGS sekvenace rozsáhlým onkopanelem všech pankreatobiliáních nádorů (včetně cytologických vzorků). V současné době největší onkopanel, který máme pro tyto účely k dispozici je panel TruSight 500 od firmy Illumina (zahrnuje přes 500 genů). S touto diagnostikou můžeme začít hned a v limitované verzi ji provádíme už několik let (od roku 2015, odkdy jsme poprvé začali s NGS sekvenací nádorů máme ji zkušenost s více než 60.000 sekvenovaných nádorů, většinově nádorů plic a měkkých tkání).
2. Likvidní biopsie těchto tumorů z periferní krve jako
   • Preoperativní diagnostiku suspektních nádorů z této lokalizace a dále
   • Jako monitorování recidivy těchto pacientů po zaléčení.
   Jako nejlepší pro tento účel jsme vyhodnotili onkopanel MSK-Sophia (právě jej validujeme v naší laboratoři) (viz Reference). S touto diagnostikou můžeme začít hned, zatím likvidní biopsie provádíme pro monitorování melanomů a zčásti nádorů plic.
3. Metylační profilizaci nádorů této oblasti pro klasifikaci těchto nádorů na základě jejich metylačních profilů. Metylační analýzy v naší laboratoři již několik let rutinně provádíme zejména pro diagnostiku nádorů CNS. Pro diagnostiku pankreatobiliárních nádorů však budeme potřebovat mít k dispozici tzv. metylační klasifikátor, který zatím pro rutinní použití není k dispozici a bude proto nutné si jej vytvořit našimi bioinformatiky. „Proof of concept“ studie o využitelnosti této technologie i v diagnostice pankreatoniliárních lézí byla nedávno publikována (viz Reference), např. u nádorů CNS je však již několik let klíčovou diagnostickou pomůckou.

Navrhuji proto po novém roce v naší laboratoři schůzku zainteresovaných odborníků ohledně tohoto budoucího programu, která se bude skládat z patologů, genetiků (popř. bioinformatiků), chirurgů a onkologů. Prof. Jiří Moláček sezve zainteresované chirurgy a onkology a naše laboratoř sezve ostatní.

Michal Michal
Bioptická Laboratoř s.r.o. Plzeň

PS. Stejně jako u projektu molekulární klasifikace endometriálních adenokarcinomů u projektu molekulární klasifikace pankreatobiliárních nádorů budeme rádi, když se k nám připojí i zařízení ostatních mimoplzeňských nemocnic České republiky.

Reference

• 1

  Michalova M, Strakova‑Peterikova A, Ondic O, Vanecek T, Michal M, Hejhalova N, Holub P, Slavik P, Hluchy A, Gettse P, Daum O, Svajdler M, Michal M, Presl J. Next‑generation sequencing in the molecular classification of endometrial carcinomas: Experience with 270 cases suggesting a potentially more aggressive clinical behavior of multiple classifier endometrial carcinomas Virchows Arch. 2024 Dec 15. doi: 10.1007/s00428-024-03996-1.

• 2

  MSK-ACCESS® powered with SOPHiA DDM™ (pdf)

• 3

  Verschuur AVD, Hackeng WM, Westerbeke F, Benhamida JK, Basturk O, Selenica P, Raicu GM, Molenaar IQ, van Santvoort HC, Daamen LA, Klimstra DS, Yachida S, Luchini C, Singhi AD, Geisenberger C, Brosens LAA. DNA Methylation Profiling Enables Accurate Classification of Nonductal Primary Pancreatic Neoplasms Clin Gastroenterol Hepatol. 2024 Jun;22(6):1245-1254.e10. doi: 10.1016/j.cgh.2024.02.007.